El objetivo de IATEC es desplegar y explotar una infraestructura de excelencia de estudio del cerebro, realizando Investigación, Desarrollo e Innovación a través de colaboraciones multidisciplinares, y buscando la rápida transferencia en beneficios sociales, especialmente en Cantabria, España y Europa.

El planteamiento estratégico de IATEC se centra en el desarrollo de colaboraciones con las principales instituciones de investigación en Cantabria, IFIMAV, UC, CSIC e IFCA entre otros, y el desarrollo de proyectos de alto interés social con el apoyo del Gobierno Regional y otras entidades públicas y privadas.